Фермент служит шаблоном, на основе которого два субстрата соединяются в правильном положении и ориентации для взаимодействия друг с другом (The Central Role of Enzymes as Biological Catalysts, GM Cooper)
Скорость высвобождения свободной энергии в клетке определяется доступностью субстрата и активностью ферментов.
Наличие большого количества, избыток одного вида субстрата (например, глюкозы) способен временно смещать метаболизм в его сторону - это называется эффект массового действия.
Но в живой клетке этот эффект ограничивается регуляторными ферментами, транспортом, кислородной доставкой и прочим.
Ферменты — это биологические катализаторы, которые ускоряют химические реакции в живых организмах, не расходуясь при этом. Они не задают направление и не изменяют максимально доступное количество энергии, но определяют скорость её высвобождения.
Хотя названия ферментов довольно сложны, большинство из них оканчиваются на суффикс -аза. Например, важный фермент аденозинтрифосфатаза, более известная как АТФ-аза, расщепляет АТФ и высвобождает накопленную энергию.
Биохимические процессы, которые приводят к получению продукта из субстрата, почти всегда включают в себя несколько этапов. Каждая отдельная стадия, как правило, катализируется определенным ферментом. Таким образом, изменение количества фермента или его активности (например, путем изменения температуры, рН, концентраций гормонов) приводит и к изменению скорости реакции.
Кроме того, для функционирования многих ферментов требуются другие молекулы, называемые кофакторами, поэтому наличие кофакторов также может влиять на функцию фермента и, следовательно, на скорость метаболических реакций.